对鸡球虫病可以采取以下方法进行确诊。
1、鸡舍是否潮湿：鸡球虫的卵囊在潮湿的环境下会加速对鸡群的感染和传播。特别是连续阴雨天时，垫料又潮湿，经常容易爆发球虫病。所以预防球虫病首先要保持鸡舍的干燥。
2、垫料上是否有血便：不管是盲肠球虫还是小肠球虫都会拉血便，一般盲肠球虫拉的血便是鲜血，鲜红色，上有时会有鲜血痕迹。小肠球虫拉的血便是暗红色，有时酱红色。因为球虫会造成肠道出血，所以感染球虫的鸡子大多会缺血，外观上表现是鸡冠发白、发黄无血。（注意要把鸡球虫病和鸡坏死性肠炎区分开）
3、解剖感染病鸡：要区分鸡球虫病是盲肠球虫还是小肠球虫，直接的方法是解剖感染鸡球虫病的病鸡，盲肠球虫病，盲肠肿大充满血液或血块。小肠球虫是小肠或十二指肠肿胀充血，外表有大量出血点。
预防和治疗鸡球虫病，先要保持鸡舍或垫料干燥。其次可以用适合的药品定期对鸡舍垫料进行消毒，鸡舍放场可用生石灰消毒，（特别是阴雨天后的鸡舍放场）。
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